新使者雜誌每年發行六期，每期皆有主題名稱，內容除了各期主題文章外，還有台灣教會人物檔案、神學淺說、解惑之窗、信仰生活、藝術文化、成長部落格、母語葡萄園、特稿、好書櫥窗、乘著夢想去旅行、潮流脈動、大專世界等，環繞三個核心：信仰的、理性的、關懷本土的。